Homeopaticky je možno léčit celou řadu akutních stavů a onemocnění, ale také chronické nemoci a stavy vzdorující konvenčním léčebným postupům. Přesto nelze tvrdit, že jde ovlivnit zdravotní komplikace každého člověka. U většiny lidí lze dosáhnout alespoň částečného zlepšení nebo úlevy.
Pro stanovení prognózy je důležitý stav obranného mechanismu těla.
Homeopat nezasahuje ani do léčby stanovené lékařem – pokud v těle nejsou ještě přítomny nevratné orgánové změny a homeopatie zlepší Váš zdravotní stav, ošetřující lékař sám sníží dávky léků nebo je úplně vysadí, když usoudí, že už nejsou potřeba. Prognóza se stanovuje nejen na základě současného zdravotního stavu, ale také se berou v úvahu údaje z celé zdravotní historie klienta. Homeopatie posiluje celkovou vitalitu organismu a nesoustřeďuje se pouze na jeden lokální problém. Délka terapie je u každého případu individuální. U chronických potíží, které trvají několik let, nelze očekávat okamžitý výsledek, ale spíše postupné pozvolné zlepšování v řádu týdnů až měsíců.
Během léčby může dojít v některých případech nejprve ke zhoršení potíží (fyzických a/nebo psychických). Toto tzv. „homeopatické zhoršení“ bývá přechodné a po jeho odeznění nastává postupné zlepšování. Délka zhoršení je u každého případu jiná a pohybuje se v rozmezí od několika hodin do několika dnů (výjimečně i několik týdnů) a neohrožuje celkové zdraví pacienta.
Během léčby se také mohou zpětně objevit méně závažné potíže, které měl pacient v minulosti, ale byly nějakým způsobem potlačeny.